《重庆交通大学学报·自然科学版》是由重庆交通大学主管主办的国内外公开发行的学术性期刊（双月刊），主要刊登交通运输工程、道路工程、桥梁与隧道工程、水利工程、航道与港口工程、环境工程、材料工程、抗震减灾工程、地质灾害等方面研究成果。
《重庆交通大学学报·自然科学版》栏目设置
本刊主要栏目：道路工程、桥梁及结构工程、港航与建筑工程、交通及汽车工程、管理工程、基础学科。
《重庆交通大学学报·自然科学版》期刊收录
美国《化学文摘社》(CAS)、美国《剑桥科学文摘》(CSA)、波兰《哥白尼索引》(IC)、中国期刊全文数据库(CJFD)、中国科技论文与引文数据库(CSTPCD)、《中文核心期刊要目总览》（2011年版）、中国科技论文统计源期刊(中国科技核心期刊)、中国学术期刊综合评价数据库(CAJCED)、中国道路文献服务中心(CRDS)核心报导期刊、国际道路科研信息（IRRD）书目文献数据库固定刊源、《中国期刊网》《中国学术期刊（光盘版）》全文收录期刊、中国科技核心期刊、中国知网、万方数据等检索库的来源期刊。